জৈব নিরাপত্তা হলো পানিতে চাষযোগ্য সকল মাছ, চিংড়ি, অন্যান্য জলজ প্রাণির রোগ প্রতিরোধের উদ্দেশ্যে হ্যাচারি, খামার এসব জায়গা থেকে নির্দিষ্ট জীবাণুগুলো বাদ দেয়ার কৌশল। গলদা চিংড়ির হ্যাচারিতে সম্ভাব্য ঝুঁকিগুলো চিহ্নিত করে, সেগুলো হ্রাস করার জন্য উপযুক্ত জৈব নিরাপত্তা ব্যবস্থা কার্যকর করা উচিত।

ব্যবস্থাপনা পদ্ধতি

• হ্যাচারিতে প্রবেশের সময় এন্টি-ব্যাকটেরিয়াল সাবান দিয়ে হাত ধুয়ে প্রবেশ করতে হবে এবং প্রতিটি প্রবেশপথে পা ডুবিয়ে প্রবেশের জন্য ফুট বাথ রাখতে হবে। যা প্যাথোজেনিক লোড কমাতে সহায়তা করে ।
• ক্লোরিন বা ব্লিচিং পাউডার মিশ্রিত পানিতে পা ডোবানোর ব্যবস্থা রাখা উচিত।
• চাষের স্থানে প্রবেশাধিকার ন্যূনতম সংখ্যক ভালো প্রশিক্ষণপ্রাপ্ত ব্যক্তিদের মধ্যে সীমাবদ্ধ রাখা উচিত।
• দর্শনার্থীদের সংখ্যা ন্যূনতম রাখতে হবে।
• ট্রে ব্যবহারের পর পরিষ্কার করা উচিত।
•  মৃত এবং দুর্বল চিংড়ি নিয়ে কাজ করার সময় অত্যন্ত সাবধানে কাজ করতে হবে। এগুলো থেকে জীবাণু সংক্রমনের সম্ভাবনা থাকে। 
• পাখি এবং অন্যান্য প্রাণির চলাচল রোধে বেড়া স্থাপন জরুরী। কারণ এসব থেকে রোগজীবাণু ছড়ায়।
• নির্দিষ্ট প্যাথোজেনযুক্ত চিংড়ির জাত, রোগসৃষ্টিকারী এজেন্টগুলোর জন্য তাদের বিকাশ ও পর্যবেক্ষণের জন্য ডায়াগনস্টিক পদ্ধতিগুলো সাম্প্রতিক চিংড়ি চাষ শিল্পের উন্নয়নে বিশাল অবদান রাখে।
• একটি জৈব নিরাপত্তা ব্যবস্থার সার্বিক এবং ব্যবস্থাপনা সংশ্লিষ্ট উপাদানগুলোতে লঙ্ঘন ঘটলে রোগ
• নিয়ন্ত্রণ এবং নির্মূলের জন্য জরুরী পরিকল্পনা আবশ্যক ।
•  চিংড়ির খাবারে প্রোবায়োটিক মিশিয়ে খাবারের গুণগতমান বাড়ানো যায় যা রোগজীবাণুর আক্রমনকে হ্রাস করে।
•  হ্যাচারিতে জীবাণুমুক্ত পরিশুদ্ধ পানি সরবরাহের ব্যবস্থা নিশ্চিত করা উচিত। এতে বায়োসিকিউর চিংড়ি উৎপাদন ব্যবস্থা পরিবেশগতভাব টেকসই এবং অর্থনৈতিকভাবে কার্যকর প্রযুক্তির প্রতিনিধিত্ব করে।